上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心（简称“公卫中心”）是复旦大学附属三级甲等医院、又名复旦大学附属中山医院南院；全国传染病医师进修教育培训基地、中国疾病预防控制中心艾滋病临床进修教育基地、上海市疾病控制中心临床基地；为复旦大学传染病学国家教育部重点学科组成部分、复旦大学妇产科学国家教育部重点学科组成部分、国家临床重点专科（传染病学）建设学组、上海市传染病重点学科建设单位之一；国家级药物临床试验机构资格认定单位；上海市危重孕产妇会诊抢救中心、上海市产科肝病监护中心、上海市艾滋病诊疗中心、上海市新发与再现传染病研究所、国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室（临床基地）建设单位。连续五届蝉联上海市文明单位。

站在新的起点，公卫人秉承“团结、奉献、诚信、卓越”的医院精神，围绕建设具有较强综合医疗救治能力的传染病临床医疗中心发展战略，为建成上海市肝病、艾滋病、结核等感染与传染性疾病诊疗中心和高水平的传染病研究基地，建成上海市公共卫生的“快速反应部队”和集医疗、科研、教学和应对突发公共卫生事件为一体的国际一流公共卫生临床中心的目标而努力奋斗。