有人曾提出，按病程长短（超过半年或1年）来划分急、慢性肾盂肾炎，但国内外的随访研究发现：患者在没有复杂性尿路情况下，大部分多次再发的尿路感染随访多年后仍没有发展为慢性肾盂肾炎。因此，慢性肾盂肾炎与尿路复杂情况密切相关，在无尿路复杂情况时，慢性肾盂肾炎极少见。常见的尿路复杂情况包括反流性肾病和梗阻性肾病。反流性肾病是指由于膀胱输尿管反流和肾内反流导致肾脏疾病；梗阻性肾病指各种原因（如尿路结石、肿瘤、前列腺肥大等）引起尿液流动障碍导致的肾脏疾病。这两者均可能合并感染，长期迁延不愈可引起肾脏纤维化和变形，而发生慢性肾盂肾炎，最终影响肾脏功能。